南海二院功能科由超声诊断科、心电图室组成。
超声（B超）室创立于1984年春，属南海首批创建的超声诊断室。目前拥有最先进的ALOKAa10彩色超声诊断仪，以及ALOKA4000(1台)和ALOKA3500(2台)彩色超声诊断仪、美国GE公司LOGLQ500彩色超声诊断仪，德国西门子公司产Adara黑白超声诊断仪（2台）及日本ALOKA1400黑白超声诊断仪1台，便携式黑白超声机1台等设备。能对各类心脏疾病及周围血管疾病、腹部各器官、浅表器官、小儿颅脑疾患加以鉴别及诊断，同时开展了腔内超声检查（经直肠、经阴道检查）及介入性超声组织或细胞学穿刺检查和介入性超声引导下治疗。
心电专业主要检查治疗设备包括：日本福田12导联心电图机，美国GE活动平板运动试验机，美国惠普24小时动态心电图分析系统，美国GE24小时动态血压分析系统，日本光电14导联脑电图机，德国DWL经颅多谱勒诊断仪，日本美能肺功能等诊断仪及肌电图诊断仪。
