儿童保健科为综合性儿童保健部门，儿童保健科设有儿科诊室、生长发育诊室、眼科、口腔科、心理卫生科、心理测评室及康复训练部，并对儿童生长发育过程中出现的各种问题进行筛查诊断及治疗。同时承担福州市五区七县儿童保健工作指导与培训、国家基本公共卫生儿童保健工作的督导检查与培训、国家级及省、市级五岁以下儿童死亡监测项目、市级托幼园所卫生保健工作管理和指导工作等。
门诊诊室功能介绍：
儿科诊室：儿童常见病、多发病的诊断与治疗，儿童营养性疾病的诊断与治疗。
生长发育诊室：婴幼儿健康体检、儿童入园（入学）体检、儿童营养与喂养咨询与指导等。
眼科：眼科常见病的诊断与治疗、儿童弱视、斜视诊断与治疗、近视、远视、散光、老视的验光、配镜矫治等。
口腔科：口腔保健、龋齿治疗、根管治疗、窝沟封闭、牙拔除、涂氟防龋等。
心理卫生科：儿童心理咨询与指导、儿童心理行为发育促进、脑损伤高危儿的筛查与诊断、儿童心理行为发育异常筛查及儿童心理疾病的诊断与治疗等。
心理测评室：儿童神经心理发育及智能发育常用量表的测评与评估等。
康复训练部：儿童语言行为发育异常康复指导及干预训练、感觉统合失调训练、自闭症儿童康复训练、脑损伤高危儿的家庭康复指导与干预训练等。
