福建省立医院心外科成立于1978年，是福建省最早开展体外循环心内直视手术的科室。1982年与福建省立医院心内科共同建立福建省心血管病研究所。迄今共完成体外循环心内直视手术10000余例，居福建省首位，代表我省心血管外科最高水平，在全国名列前茅。科室现拥有床位80张，设有ICU，高压氧舱，心外科研究室，有正高级职称医师6人，医学博士4人，医学硕士11人。
20余年来心外科诊治病人日益增多，技术水平不断提高，现能完成各种复杂先天性心脏病纠正术，主动脉外科手术，心脏多瓣膜置换术，冠状动脉搭桥术等，手术成功率达97%以上，居国内领先水平。在国内最早开展高压氧下心内直视手术；成功开展了华东地区第一例同种异体全心肺联合移植术和心脏移植术、小切口下体外循环手术、小切口不停跳冠脉手术、胸腔镜下体外循环手术、激光打孔心肌血管重建术、主动脉弓部及降主动脉瘤手术，Fontan手术,全腔静脉-肺动脉连接，Rastelli手术,Gleen手术,Senning手术,Jatene手术等,近年来开展了房间隔缺损封堵术,室间隔缺损封堵术,胸腹夹层动脉瘤血管内支架封堵术,心房颤动外科消融术,取得良好的社会经济效益。
此外心外科还承担了12项省级重大科研课题，其中心肺移植的基础及临床研究，激光心脏瓣膜成形术，心脏瓣膜置换术的临床及基础研究，动力心肌成形术，胸腔镜心内直视手术的研究均处于国内领先水平。在国内外杂志发表论文100篇，出版专著6部。承办国际性学术会议1次，全国性学术会议3次。获国家级奖2项，省科技奖9项，卫生厅科技进步奖12项。共培养研究生23人，省内外进修医生近百名。是福建省胸心血管外科学会挂靠单位。
