我院肾脏专业组1972年正式成立，当时特色为中西医结合治疗肾病综合征，诊治疾病包括肾病综合征、血尿、肾小管酸中毒、遗尿、过敏性紫癜等。1972年肾脏专业组正式成立后即实施专科随访门诊，按病种不同分别建立随访档案，如肾病综合症、血尿、狼疮性肾炎、乙肝病毒相关性肾炎、紫癜性肾炎、肾小管性酸中毒等。1979年起开展肾穿刺，是国内最早开展的单位之一，培养了10多位医生可行肾穿刺技术，1999年底开始应用B超直视下自动穿刺枪，减少了术后并发症。80年代中期开展腹膜透析技术，抢救和治疗了大量小儿急性肾功能衰竭病人，2000年购置自动腹膜透析机，改善了透析效果。2001年开始使用腹膜透析治疗慢性肾功能衰竭，极大的改善患儿的生活质量。1986年成立肾病实验室，1993年合并入儿科研究所中心实验室。1986、1987、1989、1990年曾连续举办了4期“全国肾脏病学习班”，为全国各地开展肾脏病、肾穿刺工作提供学习和指导;为满足社会需要，2002年又重新开始举办“全国性小儿肾脏疾病新进展学习班”。1977年开始参加由内科牵头的肾脏病会议，在1979年成立的全国儿科肾脏协作组中，我院郭怡清教授任副组长(1979-1997年)，在每2年举办全国儿科学术会议中，97年本专业吕红教授任学组成员，1999年本专业徐虹教授任联络员。在1985年中华医学会成立的肾脏病学会中，我院方利君教授任委员(1986-1994年)，徐虹教授任中青年委员(1998年至今)。在上海市儿科学会中，郭怡清教授任上海市肾脏病学组组长3届，盛芳芸教授继任副组长，1999年徐虹教授继任副组长。本专业组成员曾多次参加各种国际会议及交流，多次获得各部门各级别各种奖项。本专业同时是国际肾脏病学会会员及国际儿科肾病学会会员。赵孟准教授2002年受聘为我院肾脏科荣誉顾问。2004年与华山医院合作开展小儿肾移植治疗慢性肾衰等疾病。
经过不懈努力，在临床诊治、科学研究等方面取得可喜成果，特别在难治性肾病综合征、乙肝病毒相关性肾炎、系统性红斑狼疮等方面曾多次获国家和省部级成果奖。近年来成立"复旦大学小儿肾脏和泌尿系疾病诊治中心"，并成为"复旦大学肾脏病研究所"的重要部分，整合各专业优势，率先开展儿童遗尿症、膀胱输尿管返流等先天性泌尿系统发育畸形早期诊治、终末期肾功能衰竭的肾脏替代治疗(慢性腹膜透析和肾移植)等临床和研究工作，加强对儿童慢性肾脏病的早期发现，防止肾功能衰竭的进展，并创建"上海市儿童慢性肾衰竭帮困基金"。现每周开设综合肾脏病、遗尿、尿感、慢性肾衰和风湿性疾病等特色专科、专病随访门诊。
