北京中医药大学东直门医院儿科成立于1958年建院之初，是以中医为特色，中西医结合全面发展的现代化综合科室。承担本科生、七年制、硕士生、博士生、国内外进修生、留学生、港澳台学生、双学位、西学中班的临床教学。技术力量雄厚，具有一批国内外知名专家。设门诊、急诊、儿科教研室。是教育部中医儿科硕士学位授予点，中医儿科学博士学位授予点。为全国中医药高等教育儿科学会牵头单位，徐荣谦教授担任理事长，王俊宏教授担任秘书长。曾主编、副主编《医宗金鉴幼科心法要诀》、《医学百科全书中医儿科分册》、《中医儿科治疗大成》、《儿科病中医诊疗》、《今日中医儿科》、全国高等中医院校协编教材《中医儿科学》、北京市精品教材立项《中医儿科学》等数十部教材、专著。
北京中医药大学东直门医院儿科承担着国家七五、国家十五科技攻关与十一五课题科技支撑课题、部局级及校级课题多项。主要对肺炎、重症肌无力、进行性肌营养不良、病毒性心肌炎、厌食证、多发性抽搐症、儿童注意力缺陷多动障碍、过敏性紫癜、反复呼吸道感染等进行了深入研究。是国家中医管理局重点学科-中医儿科学的协作建设单位，参加编写了小儿抽动-秽语综合征诊疗常规的编写；并系统进行了中医儿科学的传承研究，系统的研究总结了刘弼臣教授在中医儿科基础理论上的“少阳学说”理论与中医儿科“从肺论治”的学术思想与医疗特色。
北京中医药大学东直门医院儿科具有完善的诊疗设备，如胃肠电图仪、中频治疗仪、超声电导仪、雾化泵、周林频谱仪、红光治疗仪、儿童注意力测试仪等多种检查治疗设备。多年来研制了多种儿童制剂，如复方玄参清解合剂、麻杏止咳合剂、玄芪养心颗粒、复力颗粒、复痿颗粒在临床应用多年取得很好疗效。年门诊量3.5万人次，全年业务收入560万元。现有专业技术人员12名，其中主任医师3名，副主任医师2名，主治医师4名，主管护师1名，护师2名；博士生导师1名、硕士生导师3名。
儿科近年来开展了多项特色疗法，主要有：冬病夏治穴位贴敷疗法，用于治疗支气管哮喘、过敏性鼻炎、反复呼吸道感染等；拔罐疗法，适用于治疗风湿痹证、感冒咳嗽、胃痛、腹痛腹泻、落枕以及肺炎恢复期；小儿脾胃病中医推拿疗法，适于小儿消化不良、营养不良、消化功能紊乱、肠道寄生虫病以及由于上述疾病迁延不愈而并发的贫血、佝偻病以及多种维生素缺乏症，同时还可以保健；敷脐疗法，采用参苓白术散、保和丸、葛根芩连汤等加减研末敷脐，根据中医辨证，分别适于脾胃虚弱、伤于饮食和湿热蕴脾泄泻，还可用于遗尿；穴位中频电疗法适于腹痛、呕吐、遗尿等证；电超导经皮穴位给药治疗，根据疾病不同，选用不同穴位，具有一定疗效；红光治疗，能够增加白血球的吞噬作用，同时也具有提高机体免疫功能的作用，还可以降低五羟色胺含量，起到镇痛的作用，适用于小儿肺炎、婴幼儿腹泻、风湿性关节炎、类风湿关节炎、骨性关节炎、支气管哮喘、颌关节炎、喉炎、鼻前庭炎等疾患的治疗；耳穴疗法，能够有调整机体内分泌系统以及内脏功能的作用，适用于小儿哮喘、遗尿、肥胖、近视弱视、多动症、抽动症、泄泻、痢疾、月经不调等疾病的辅助治疗；还用刮痧、中药雾化吸入等，配合中药治疗，临床取得较好的疗效。
