医院耳鼻咽喉科技术力量相对雄厚，设备先进，管理规范，对耳鼻咽喉科的常见病、多发病常规开展门诊及住院工作，运用耳鼻咽喉内窥镜系统（如耳内窥镜、鼻内窥镜、纤维喉镜等），对于该科一些隐匿性疾病及早发现并治疗，大大提高疾病的确诊率及治愈率。长期以来，该科在专业技术上精益求精，不断进取与创新，逐渐形成了一整套诊疗常规，特别是成功抢救了较多例急性喉梗阻、头面颈部复杂复合外伤、急性鼻腔及咽喉大出血等一系列危重病例，在耳鼻咽喉科的抢救及外伤方面积累了一定的经验。同时，积极拓展耳鼻咽喉科择期手术，特别是在中耳鼓室成形术、功能性鼻内窥镜鼻窦手术、鼻内窥镜下鼻中隔偏曲矫正术、鼻内窥镜下鼻腔泪囊吻合术、支撑喉镜及纤维喉镜下咽喉肿物切除术、扁桃体及腺样体摘除术等多种择期手术上达到市级领先水平。
听力筛查室
20世纪90年代初，欧美国家率先开展了新生儿听力筛查；我国新生儿听力筛查开始于20世纪末，北京、山东、浙江等地首先开展，此后在全国逐渐推广。近些年，该院新生儿出生多，本着优生优育的思想，该院于2003年开展成立听力筛查室。到目前已筛查新生儿约2500名，疑似先天性听力损失2例，并能建议听力损失者早发现早干预，如建议尽早上级医院进一步检查佩戴助听器、或行人工耳蜗、听力康复的语言训练等。
变态反应室
变态反应室成立于2009年，主要承担该地区过敏性疾病过敏原的统计研究及舌下药物的脱敏治疗。变态反应室在东莞市成立较早，已经对该科的许多过敏性鼻炎、变应性咽炎、过敏性结膜炎等以及对呼吸道的变应性哮喘有较好的持续性疗效；开展以来，取得了良好的社会效应。
该院眼科自建科以来，眼科和医院同步发展，务实求精，积极发展，不断创新，到目前为止，该院眼科凝聚了一批致力于眼科事业发展的具有老、中、青相结合的梯队型眼科专业人才，对该地区的常见眼病的预防和诊治做出了较大贡献。眼科业务上除了开展常规眼科门诊疾病的诊治以外，住院开展了翼状胬肉切除术+羊膜移植术、白内障囊外摘除术、白内障超声乳化术、青光眼小梁切除术、鼻腔泪囊吻合术、斜视矫正术、常见眼外伤修复整形术、眼球摘除+羟基磷灰石义眼台植入术等。于2007年下半年开始，在市防盲办协助下聘请知名专家协助大力开张白内障超声乳化人工晶体植入术。与此同时，积极开展科研教学工作，目前正开展《社区群体干预对青少年近视防治的效果观察》的市级科研课题。
