医院肛肠科创建于1958年，是集医疗、教学、科研、预防保健于一体的大连市一级重点学科；是辽东半岛肛肠病预防治疗和研究中心，大连市肛肠病防治中心和大连市肛肠病研究所。 科室拥有一支老、中、青结合，梯队合理，训练有素，学术优势互补，服务一流的人才队伍。目前，科内有医护人员75人，其中教授（主任医师）8人，副教授（副主任医师）15人 ，具有博士学位4人，硕士学位8人，硕士研究生导师4人。
肛肠科下设五个科室。肛肠一、二科以结、直肠癌等大肠疾病的诊治为主；肛肠三、四科以痔瘘裂等肛周常见疾病的手术治疗为主；肛肠五科以便秘、结肠炎、慢传输疾病等中医治疗为主。科室床位210张，按现代化三级甲等医院建设标准设置单人高档病房、双人高档病房、三人中档病房和普通病房，年均门诊量1.5万人次，收住院患者4000余人次，肛肠病手术3500余例；其中，结直肠肿瘤手术300余例，约占全市大肠癌总手术量50%。
肛肠专科拥有电子结肠镜、肛门直肠压力测定仪、肠道治疗仪、电脑高频电刀、微波治疗仪、数字X光机、彩超等大型专科诊疗仪器。科室在继承传统优势特点的基础上，不断探索发展，能够进行痔、肛裂、肛瘘、肛周脓肿、直肠阴道瘘、直结肠癌等60余种肛门直肠常见及疑难病的中西医结合治疗。对于痔、裂等常见病，手术力求精细，复发率低，后遗症少；对于高位复杂性肛瘘、肛周脓肿采用切开挂线术，避免术后肛门失禁的危险；对大肠炎症性结肠病、便秘等，采用中药保留灌肠及中西医结合治疗，疗效显著；对多发性息肉患者，采取中药辩证治疗配合肠镜烧灼方法，疗效显著。其它如：分段结扎治疗环痔，注射治疗大肠息肉，简易手术治疗直肠脱垂等专科治疗技术都得到了广大患者的肯定。同时可以完成包括高位复杂性肛瘘括约肌无损伤根治术，肛门成形术，括约肌再造术，直肠癌根治术在内的所有肛肠外科手术。大肠良恶性肿瘤手术治疗居省内前列。肛肠科是最早在国内开展直肠癌低位、超低位根治保肛手术；“J”型储粪袋吻合术应用，大大提高了直肠肿瘤患者术后的生活质量。长期以来我们在治疗肛肠疾病上，不断改进，形成了一整套以手术治疗为主，传统中医疮疡外科换药技术、激光理疗、超声波雾化熏洗治疗为辅，行之有效的综合治疗体系。
近年来，开展结肠镜和腹腔镜联合微创结直肠肿瘤手术治疗和结直肠癌的综合治疗，在肛肠疾病的无痛和微创治疗上取得很大进步。科室连续多年承担国家级和省部级等科研项目，获多项得科技成果及专利。科研成果直接应用于临床，大大提高了科室的整体诊疗水平。
肛肠科全体医护人员将始终秉承“以病人为中心”的服务宗旨，为广大就医患者提供优质满意的医疗服务。
