眼科是目前苏州地区二级医院中规模最大的眼病专业治疗机构。现有床位39张，拥有进口手术显微镜、超声乳化仪、玻璃体切割仪、多种眼科激光仪、眼底荧光造影仪等先进设备，环境设施达到了省内一流，年手术量在本市处于领先地位，在苏州地区名列前茅。
上世纪80年代，眼科在全国县（市）级医院中率先开展现代白内障囊外手术，其技术成果获江苏省卫生厅科技进步奖一等奖；90年代，眼科又率先开展白内障超声乳化摘除术。2001年，眼科在苏州地区二级医院中率先开展玻璃体切割术。2004年，又在本市率先开展准分子激光原位角膜磨镶术（LASIK）治疗近视眼。眼科还开展眼前后段激光治疗、角膜移植术、眼面整形美容手术、青光眼临床前期研究、各类现代青光眼手术研究及临床应用等。2005年，眼科又先后成立白内障超声乳化治疗中心、眼底病诊疗中心，近视激光治疗中心、学科专业进一步细化。
