为2003年云南省卫生厅批准挂牌的研究中心之一。中心依托医院儿科临床科室和辅助部门，开展临床研究工作。中心设有12个研究室和一个中心实验室，对儿童呼吸系统、心血管、血液、神经、肾脏、新生儿、遗传代谢等系统的疾病的防治进行研究。同时设有儿童听力—言语、语言研究室、电生理研究室、小儿内窥镜应用研究室及中心实验室。
昆明市儿童急救培训中心：1982年医院被联合国儿童基金会确立为全国十三家儿童急救培训中心之一，中心成立至今为省内108个县市培训了近四千名儿科医护专业人员，使全省26个少数民族都有了自己的儿科医生。
