北京大学眼科中心始建于2001年10月，座落于北京大学第三医院眼科中心大楼内，建筑面积10,000m2；集眼科临床、教学和科研于一体，为国 家重点学科。眼科中心由美国约翰霍普金斯大学曹安民教授担任首任主任，2010年4月至2014年8月，由我国著名眼底病专家马志中教授继任主任，王薇教授、郝燕生教 授任副主任。自2014年9月起，王薇教授担任主任，洪晶教授、王常观副主任医师任副主任。
北京大学第三医院眼科中心重视人才战略和梯队建设，下设9个亚学科，分别与国际眼科亚科相对应，即：玻璃体视网膜科、白内障与 老年眼病科、眼外伤与人工晶体科、角膜科、青光眼科、准分子激光科、斜视与小儿眼科、眼底病内科和眼整形美容科。从全国招聘眼科著名教授、一流专家担任亚 学科主任，在自主创新的平台上组成眼科中心飞速发展的骨干力量。眼科中心亚学科学术带头人包括：王薇教授、郝燕生教授、洪晶教授、吴玲玲教授、陈跃国教授、王乐今主任医师、刘瑜玲主任医师、王常观副主任医师、田彦杰副主任医师等。
眼科中心设有病床80张，日门诊量700人次，年手术量10,000例。外省病人转诊比例由2001年的5％增长到2010年的34％以上，表明我院的诊疗实力在全国眼病患者心目中的影响力日益突显。眼科医院现有博士生导师6名，硕士生导师9名，2010年培养博士后1名，博士生28名，硕士生16名，进修医43名。眼科中心拥有世界最先进的眼科设备及眼科医疗、教学和科研平台，跻身于国内Top Ten最主要眼科机构之一。
眼科中心充分体现人文关怀的诊疗环境（门诊、病房、手术室）
位于眼科中心大楼六、七层的眼科研究所，占地1,125m2。拥有激光共聚焦显微镜、超高速冷冻离心机、视觉电生理仪、荧光显微镜及照相系统、凝胶成像系 统、超薄冰冻切片机、梯度PCR仪等先进实验设备和实验平台。拥有病理研究室、分子生物学实验室、眼库、免疫实验室、干细胞实验室、超微结构实验室，以及 Dry Lab和Wet Lab两个教学实验室，是功能强大的眼科基础研究平台。眼科中心秉承北京大学医疗机构的特点，十分重视科研工作，2010年在国外权威眼科杂志共发表19 篇SCI论文，在研课题基金包括国家自然科学基金、科技部“973”课题基金、北京市自然科学基金、教育部博士点基金、北京市科委基金、教育部新教师基金 等，基金总数逾千万。
眼科中心专设防盲治盲办和国家临床药理实验基地，承担着国际眼科理事会（ICO）-- 北京大学Eli Lilly糖尿病眼病防治中心、全国眼外伤登记、卫生部健康快车等重要防盲任务，每年平均接受至少4-5项临床药理实验任务。为广大患者带来光明的同时， 承担本市和外省医师的大量培训任务，为全国老少边穷地区培养眼科医师，构建联网式模拟教学平台。
中心同时拥有一支训练有素的优秀护理队伍，分别承担了门诊、手术室和病房的护理工作。成立至今，始终坚持以患者为核心、提高护理质量、致思学科发展、建立专科护理服务内涵。
北京大学第三医院眼科中心环境幽雅、温馨，服务热情、周到，其独具匠心的医疗空间设置，令人耳目一新，充分体现人文关怀的整体设计，曾被媒体称之为“彩色 的眼科医院”。中心全体医护人员致力于中国眼科事业的发展，愿意为全国防盲治盲工作贡献力量，并努力使之成为国际著名的眼科中心。
