功能神经科位于新病房楼9层东段，设置床位26张，工作人员20余名，是海淀医院重点学科之一。海淀医院功能神经科是国内治疗癫痫及功能性神经疾病的第一个国际化的正规诊疗中心。拥有国内最先进的Nicolet癫痫电生理监测系统，其中128导监测系统（“癫痫刀”）2套、32导及术中脑电图监测系统、睡眠视频脑电图监测系统共8套。有国内最先进的射频毁损系统（Cosman射频仪）、手术计划系统和立体定向系统；3.0T磁共振、数字血管造影机、SPECT、微电极记录系统等设施，功能性神经疾病的硬件诊治设施位居全国前列；它还拥有国内外一流的医护团队，由神经外科、神经内科、电生理科、神经影像科专业医师、基础护理人员和电生理技师等组成，科室核心人员均为硕士研究生以上学历。科室主任由国内著名的功能神经外科专家李云林和著名神经内科专家王晓飞担任。他们曾于欧洲、日本等发达国家留学学习，在国内该领域有很高的知名度。科室主要开展癫痫、帕金森病、疼痛、脑瘫等疾病的综合评估和外科手术。已经开展的“大脑半球切除术”治疗婴儿痉挛性偏瘫伴癫痫、Sturge-Weber综合征等手术居国内领先地位，受到《北京电视台》、《云南电视台》、《中国社会导刊》等媒体的高度关注。
本着“服务社会大众、改变患者人生”的原则，科室拟与美、日本等发达国家联合成立中外合作的癫痫综合诊治示范基地，拟创建国内第一个国际化的IV级癫痫中心。
