首都医科大学附属北京口腔医院儿童口腔科是集临床医疗、教学、科研于一体的临床科室，现有医师22人、护士12人。其中主任医师3人，副主任医师3人，主治医师5人。共有15台牙科综合治疗椅及1台手术用治疗椅。儿童口腔科以常见病和多发病的诊疗为基础，以解决疑难病例为重任，专科业务发展方向主要有儿童龋病的早期诊断和治疗、乳牙及年轻恒牙牙髓病和根尖周病的治疗、儿童牙外伤序列治疗、儿童咬合诱导、儿童口腔外科治疗以及特殊儿童牙病治疗。科室年完成门诊量4万余人次，接诊儿童患者来自北京及全国各地，其中外地患者及外院转诊病例超过50%，解决大量疑难病例，受到同行和社会各界的广泛认可。在治疗过程中，严格控制交叉感染，使用一次性检查器械，牙科钻头一人一机随时消毒。
儿童口腔科承担首都医科大学口腔医学院本科生及研究生教学工作，为硕士学位授予单位。目前承担国家级及省部级课题多项。
科室主要承担0-14岁儿童各种口腔疾病的诊治。包括：
1、乳恒牙龋病预防：氟化物涂布、年轻恒牙的窝沟封闭等。
2、牙体牙髓病：治疗乳恒牙龋齿、牙髓病、根尖病等疾病。
3、牙周粘膜病：诊治儿童牙龈炎、牙周病，以及儿童粘膜病。
4、儿童牙外伤的诊断及治疗。
5、咬合诱导：牙列发育异常及不良习惯的预防性矫治和牙齿早失的间隙管理。
6、口腔软组织及牙槽外科手术：唇、舌系带矫治术，口腔软组织囊肿、埋伏牙摘除术等。
7、全身麻醉下牙齿治疗：适用于低龄及残障等不能配合治疗的特殊患儿的牙齿治疗。
