北京大学第三医院急诊科创建于1984年，是我院的临床科室之一。张恩雨主任医师曾任首届急诊科主任。陆权素、丛玉芳、毛节明、邓正照、贺蓓、郭长吉等专家曾先后任急诊科主任，赵鸣武、藏友梅、王瑞儒、葛堪忆、黄雪彪、郭丽君等专家曾任急诊科副主任。急诊急救医学是临床医学、基础医学与多学科互相结合、互相渗透的、特殊的、新兴的综合性边缘学科。随着医学科学的快速发展和社会需求的不断增长，急诊急救医学受到了极大的重视。近年来，我院领导非常关心和支持急诊科建设，投入大量人力、资金，不断壮大队伍、配备设施，组建了一支以内科医师为主体的急诊医师队伍。郑亚安主任和刘桂花书记带领急诊科全体人员，团结协作、共同努力，重视和加强学科建设、建立健全规章制度,改善医疗环境、整顿医疗秩序、细化急诊流程、狠抓服务态度、提高医疗质量、力保医疗安全，使急诊科的面貌焕然一新，先后获得“五一劳动奖状”、先进党支部、服务创新奖等多项荣誉。
急诊科与心内科、呼吸科、消化科、神经科、肾内科、内分泌科、血液科、介入科及外科系统相关科室密切合作，共同建立紧急救治危重病人的医疗平台，充分发挥和利用急诊科拥有的技术力量和先进的仪器设备。使呼吸心跳骤停、休克、急性中毒、急性冠脉综合征、急性肺栓塞、呼吸衰竭、肾功能衰竭、糖尿病危象、急性脑血管病、急性胰腺炎、消化道出血、多发复合伤等各科急症均可在急诊科接受溶栓、介入、呼吸支持、血液净化、内镜检查治疗等先进的医疗技术服务，使患者得到及时有效的救治。2009急诊科实施心肺复苏 512例，急性呼吸衰竭呼吸机治疗313例，累计上机时间1678小时。急诊科与心内科、呼吸科、神经科、消化科、介入科共同建立的绿色通道保证急性冠脉综合征、急性脑血管病、急性血栓栓塞和急性出血患者得到及时有效的救治。2009年急诊心脏介入治疗548例，急性脑血管病溶栓治疗 79例，急性肺栓塞及其他血管栓塞介入治疗 72例，急诊胃、肠镜 1626例。
近几年随着学科的建设和发展，急诊科现有固定医护人员98人，其中医师21人，包括主任医师1人、副主任医师2人、主治医师8人、住院医师11人，其中医学博士1人、硕士13人、在读博士2人、在读硕士1人;护士77人，其中主管护师9名、护师22名。急诊科拥有最先进的呼吸机19台、除颤仪3台、洗胃机 3台，血液灌流机2台，惠普中心监护系统(1拖8)及遥测监护系统4套(1拖8)、血气分析仪4台。全院各科室均设急诊值班人员，随时接诊专科急诊病人，及时抢救危重病人，随时为病人实施 电除颤、电复律、呼吸支持、洗胃、血液净化、生理、生化指标监测等抢救措施。
急诊科构成分为各科诊室、抢救室、洗胃室、手术室、观察室、输液室、病房等部分，抢救室设置9张抢救床位，观察室设置16张留观床位，病房设置24张住院床位，其中有6张重症监护床位，基本上满足了日常诊疗的需要。2009年急诊科就诊总人数158959人，日均435人，抢救总人数3489人，抢救成功率92.8%，抢救床使用率212%;留观总数32153人，人均留观人数88人，加床率400%;急诊病房入院490人次，平均住院日15.6天，床位使用率92.9%.
