包钢三医院肛肠科是医院重点专科。现有病床38张，在包头市及周边地区有较高知名度、每年接待患者约2000人次，科室拥有大型肛肠治疗仪，电子直肠镜，高频电刀，全自动中药熏洗仪，带冷光源肛门镜，痔科套扎器等先进诊疗设备。现为卫生部中日友好医院肛肠病安氏疗法中心临床协作医院，微创治疗痔疮技术（HCPT）示范基地,中国医师协会肛肠专业包头地区临床援助中心。
包钢三医院肛肠科专治各种肛门、直肠和结肠疾病。采用国内最先进的卫生部中日友好医院肛肠科“安氏疗法”及中国中医科学院广安门医院肛肠科中西医结合治疗肛肠疾病新方法，结合微创技术，目前在痔疮、肛瘘、肛裂、肛周脓肿、直肠脱垂、溃疡性结肠炎、肛门尖锐湿疣、先天性婴儿肛门闭锁和结直肠肿瘤等诊治方面有独到之处并处于领先水平。注射治疗是本科的特色之一，痔疮的一次性注射治愈率超过95%；对于各种高位复杂性肛瘘和肛周脓肿采用“安氏疗法”，在保证治疗彻底的前提下保护肛门功能和外观；采用注射加微创手术治疗环状混合痔，嵌顿痔，一次彻底治疗的同时较好的解决了术后肛门皮肤缺损，肛门狭窄等难题；注射加结扎和肛门紧缩术成功解决以往开腹都难以治愈的直肠脱垂；一次性手术治愈先天性婴儿肛门闭锁和直肠阴道瘘。
近三年完成自治区科技厅，包头市科研项目3项，均获科技进步奖。
