胃肠外科1区，现有医护人员26人。其中医师8人，包括主任医师、教授2名，副主任医师2名，主治医师2名。年手术量500余例，并能联合内窥镜、腹腔镜等新技术进行综合治疗。大量开展胃肠道肿瘤及肠梗阻等大型手术，如联合脏器切除、残胃癌的根治术、复杂性肠癌根治术等，提高病人的治愈率。在内镜外科方面，开展胃肠镜、胶囊内镜检查治疗，在省内最早开展经十二指肠镜下肝胆胰疾病的检查及治疗，内镜下胃肠道息肉治疗例数居省内之冠。近年开展了内镜下新技术：内镜下经皮胃、空肠造瘘术，消化道狭窄支架植入术。开展肠外、肠内营养治疗技术，对围手术期及胃肠道功能障碍的病人进行合理的肠内、肠外营养综合治疗。对复杂性胃肠道瘘、炎症性肠病的综合治疗居省内领先。
承担福建医科大学外科学教学任务，每年培养6名硕博研究生，承担多项省内科研课题，并发表国家级、省级论文十余篇。
学科带头人李良庆主任，福建省内窥镜学组副主任委员，福建省抗癌协会理事，留美学者。
