儿科是我市唯一设有病房的儿童专科，集医教研预防保健为一体,近几年来在国家级核心杂志上发表论文30余篇,专科技术力量、设备条件、科研水平等整体实力较为雄厚。科内有医生8人，护士12人（其中正高职1人，副高职2人，中职5人，初职12人）。
科室配有心电监护仪2台，蓝光治疗仪温箱4台，红外线抢救台2台，经皮胆红素测定仪1台，这些先进的治疗设备使儿科在抢救急危重病儿、早产儿、低体重儿及黄疸小儿时方便、安全而且价廉。配备的气泵雾化治疗仪6台，在哮喘、支气管炎治疗方面能够达到三甲医院水平。对一些疑难病，如川畸病、白血病、肾病等，其治疗方案与南京、上海医院儿科同步。现在还开展了儿童血微量元素检测。
儿科每年的门诊诊疗人次、住院人数、抢救危重病儿数在滁州地区为前列。
