温州医科大学附属第二医院小儿心胸外科创建于八十年代中期，是浙南地区最早开展小儿心胸外科手术的临床科室之一，学科集临床、教学、科研和培训于一体。在学科带头人胡型锑教授（系中国医师协会心血管外科专业委员会委员、浙江省小儿外科副主委，浙江省小儿心脏外科学组副组长，温州市心胸外科协会副主任委员）的带领下，全科上下团结协作，学术水平处省内领先地位，科内主要成员都有赴国内、外先进心脏中心的进修经历。科室目前有床位24张，监护室床位5张；主任医师1名、副主任医师3名、住院医师1名、灌注师1名，梯队建设合理。
温州医科大学附属第二医院小儿心胸外科以治疗各种先天性心脏病为主，同时在儿童肺部、食管、纵隔、膈肌疾病以及脓胸等治疗方面也独具特点，已经建立起包括心外、心内、麻醉、影像诊断、体外循环、术后监护等相关科室的手术班子，分工合作，使患者得到个体化、精确化的治疗；同时本着“以我的真心，换你的顺心”的理念开展护理工作，提倡制度化管理，保证各项护理工作安全、有序、有效的进行。目前每年完成各类手术约400余台，是省内开展小儿心胸外科手术最多的科室之一，治疗病种及手术成功率均居全省前列。
小儿心胸外科对各类紫绀型与非紫绀型先天性心脏病的外科治疗处于省内领先水平，常见先心病的手术成功率达99％；尤其在低龄、低体重、新生儿危重先心病的外科手术中取得了突破性的进展，其中一例患儿的体重只有1.9公斤；近年来＜2岁的先心病手术占总体外循环手术量的80%，＜1岁的占50%左右，均居省内领先水平。心胸外科能独立完成各类复杂先心病的外科手术，如Switch术，双向Glenn术， Fontan术，Rastelli术，Ebstein畸型矫治术、全腔肺动脉吻合术、完全性房室间隔矫治术、完全性肺静脉异位引流矫治术等等。此外，还开展了微创漏斗胸矫治术(在浙南地区率先开展了国际上目前最先进的微创Nuss术)，右胸小切口心脏微创直视术，不停跳心内直视术，内、外科镶嵌治疗（Hybrid技术），无血预充、新法改良超滤在体外循环术中的应用等新技术。
