同济大学附属东方医院胃肠肛肠外科是以结直肠肛门疾病与胃部疾病的诊断与治疗为特色，集医教研于一体综合发展的专业化科室。在我国著名结直肠外科专家傅传刚教授的指导下，科室目前已发展成为拥有设备先进、功能完善的结肠镜检查治疗中心和专业肠造口门诊的一体化胃结直肠肛门外科。形成以结直肠癌内窥镜早期诊断、手术和综合治疗；顽固性便秘诊断与外科治疗；重度脱垂性内痔和混合痔的外科治疗；复杂性肛瘘的外科治疗；结直肠良性疾病的内窥镜诊断与治疗；肠造口护理等为主的专业特色，在国内居于领先地位。
胃肠肛肠外科坚持严格规范的手术标准，严格遵守“根治性、安全性、功能性”的手术原则，减少了手术并发症，力争获取最佳的预后，提高病人的治愈率和生存质量。在手术技术和设备方面处于国际领先水平，“3D腹腔镜下拖出式无切口结直肠手术”，“直肠拖出式经括约肌间吻合器切除吻合术（PISTA）”，“经肛微创结直肠外科手术(TAMIS)”，并在国内较早采用双吻合器技术进行中低位直肠癌手术，手术时间明显缩短、保肛率达到国内领先水平，使绝大多数患者避免做永久性人工肛门，术后局部复发率明显降低；通过开展腹腔镜微创手术、内镜与腹腔镜结合的双镜联合手术，使患者术后手术切口小，恢复快，住院时间缩短。
目前，全科共有医护人员45人，其中教授4人，副教授3人，博士生导师3人，硕士生导师3人，高级职称医师11人，国际造口师（ET）2人。科室拥有电子内镜诊治平台、3D腹腔镜微创手术平台，设备先进、功能完善。诊治能力涵盖了结直肠肛门外科、胃外科的所有疾病门类，在大肠癌、胃癌、复发性肠癌、慢性便秘、各类痔病、直肠海绵状血管瘤、家族性腺瘤性息肉病、巨结肠、炎性肠病（溃疡性结肠炎、克隆恩病）、痔疮、藏毛窦、复杂性肛瘘、肛周脓肿、肛裂、直肠脱垂、骶前肿瘤、复杂性直肠阴道（尿道）瘘等疾病的手术治疗及肠造口护理治疗等领域具有丰富的临床经验。
胃肠肛肠外科作为同济大学医学院、博士学位、硕士学位授予点，每年培养博士及硕士研究生10多人，来自美国、德国、瑞士留学生、国际交流生20余名。科研方面主要以大肠癌的早期诊断、转移机理、直肠癌保肛手术的技术改进及术后控便能力的改善、大肠癌的综合治疗等基础和临床为主，承担国家自然基金4项、教育部博士点基金1项、上海市科委科技攻关课题1项，上海市科委等市级课题8项，获得省部级科技奖5项。主编和参加编写专著12部。
