普通外科创建于1954年，是国家重点学科共建单位、江苏省临床重点专科和南京市医学重点专科。为南京大学、南京医科大学博士、硕士学位授予单位。设有肝胆外科、内分泌外科、胃肠外科、器官移植科、微创外科五个病区及介入治疗科，编制床位164张，现有医护人员76人，其中主任医师6人，副主任医师15人，主治医师10人。
