1945年3月生,浙江温州人,1962~1968年就读于浙江医科大学医疗系。1978~1981年成为北京协和医院张孝骞教授和陈敏章教授的研究生,从事胃肠病的研究。1981年获硕士学位。1992年起任硕士研究生导师,1994年起任博士研究生导师。柯美云教授较全面掌握消化系统的基础理论和专业知识。1980年初应用腹腔镜结合病理诊断肝病,并和各种影像学进行对照,评估了腹腔镜对诊断肝病的价值。80年代后期提出选择性小肠造影结合诱发试验诊断不明原因的小肠出血。1984年底从美国进修回来后,和放射科、核医学科合作,建立了系列胃肠动力的检查方法,使之能应用于国内。